中国三峡新能源公司(以下简称三峡新能源)的前身是1980年成立的水利部水利工程综合经营公司。该公司为事业编制,起初与水利部工程管理司合署办公,主要负责水利综合经营的行业管理工作。1985年9月,水利电力部将水利部水利工程综合经营公司改组为中国水利实业开发总公司,实行企业化管理。1991年12月,中国水利实业开发总公司更名为中国江河水利水电开发公司,逐步与市场接轨,公司主营水利水电工程、城镇供水工程的开发、咨询、机械成套、总承包以及水利旅游、沙棘开发等。1997年12月,为适应国家投融资体制改革,水利部将中国江河水利水电开发公司更名改建为中国水利投资公司,原国务院副总理邹家华出席挂牌仪式并为公司题词:“深化投资体制改革,加快水利产业化进程”。1998年11月,与水利部脱钩,移交中央企业工委管理,2003年4月以后纳入国资委管理。2006年8月,国水投资集团注册成立,同年10月,中国水利投资公司更名为中国水利投资集团公司。2008年10月,中国水利投资集团公司并入中国长江三峡集团公司(以下简称集团公司)成为其全资子企业。2010年6月,正式更名为中国三峡新能源公司。