执业药师注册有效期是三年。持证者须在有效期满前三个月到原执业药师注册机构申请办理再次注册手续。超过期限，不办理再次注册手续的人员，其《执业药师注册证》自动失效，并不能再以执业药师身份执业。 国家药品监督管理局建立完善全国执业药师注册管理信息系统，国家药品监督管理局执业药师资格认证中心承担全国执业药师注册管理信息系统的建设、管理和维护工作，收集报告相关信息。《执业药师注册管理暂行办法》第八条有下列情形之一的，药品监督管理部门不予注册：（一）不具有完全民事行为能力的；（二）甲类、乙类传染病传染期、精神疾病发病期等健康状况不适宜或者不能胜任相应业务工作的；（三）受到刑事处罚，自刑罚执行完毕之日到申请注册之日不满三年的；（四）未按规定完成继续教育学习的；（五）近三年有新增不良信息记录的；（六）国家规定不宜从事执业药师业务的其他情形。
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