住院医师规培主要以临床实践、专业课必修、公共必修专业课为培训的主要内容，要求住院医师在两个阶段分别通过考试取得相应课程学分。就培训阶段来说，第一阶段为期3年，在二级学科范围内，轮转参加本学科各主要科室的临床医疗工作，进行全面系统的临床工作基本训练；第二阶段为期2年，进一步完成轮转，逐步以三级学科为主进行专业训练，深入学习和掌握本专业的临床技能和理论知识，最后一年安排一定时间担任总住院或相应的医院管理工作。就培训内容来说，临床实践以在岗培训为主，由科室集体指导；外语及专业必修课主要通过自学完成，部分公共必修课和选修课则通过业余办班面授完成，也可通过自学、参加该课水平测试获得学分。对工作满5年，学分符合要求者，经临床能力考核合格，发给住院医师培训合格证书，作为申报中级专业技术职务任职资格的必备条件。为部分在职临床医师申请临床医学专业学位所需，对从事临床工作3年以上，完成住院医师第一阶段规范培训并通过考核者，可发给《住院医师规范化培训合格证书》。此外，住院医师规培的考核分平时考评和阶段考试、各医院自行组织考核和省、市高等学校统一组织的理论考试、计算机考试等不同方式，从科室考评、外文水平、专业理论和临床能力这四个方面进行考评。
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