(1)虽然两个资格证书都是助理医师资格证，但主要区别在于乡村全科助理医师拥有处方权，但是执业范围限定于该乡镇卫生院或村卫生室。而临床助理医师没有处方权，但执业范围全国各个省市地区都是可以的，并可以参加职称评定使用。(2)关于乡村全科助理医师是否可以直接考取临床执业助理医师资格证书，目前国家政策尚不明确。(3)临床执业医师考试报名条件：取得执业助理医师执业证书后，具有高等学校医学专科学历，在医疗、预防、保健机构中工作满二年;取得执业助理医师执业证书后，具有中等专业学校医学专业学历，在医疗、预防、保健机构中工作满五年的。(此处的工作年限是从助理证书注册之后算起)综上，在乡镇行医，不想继续考临床执业医师，但是想要有处方权，可以选择注册乡村全科助理医师。如果想去其他地区行医或是参加职称评定，并且想要继续报考临床执业医师，建议注册临床执业助理医师。
和信长庆
