1、工作职责不同助理是做辅助性工作的，所以不具有独立处方权，需要在医师的指导下才能进行处方。拥有执业医师资格的人在正规医疗、预防、保健机构中，可以被聘为医师，能够独立处方。而具有执业助理医师资格的人，只能被聘为医士。医生独立开办诊所、医院是需要有医师资格的，但执业助理医师不享有此权利。执业医师可以异地、跨省执业，执业助理医师只具有在县级行政区域执业的权利。2、薪资待遇不同执业医师资格的含金量是明显高于执业助理医师资格的。执业医师资格可以考取卫生资格中级职称，而执业助理医师，即使经验丰富、专业技能强，也是白搭。而且执业助理医师的薪资福利待遇和补贴是要比执业医师低的，虽然两者都是初级职称。3、报考条件不同执业助理医师资格的报考门槛比执业医师要低。具有高等学校医学专科学历或者中等专业学校医学专业学历，在执业医师指导下，在医疗、预防、保健机构中试用期满一年的，就可以报考执业助理医师资格。报考执业医师资格，则需要是高等学校医学专业本科及以上学历，并且在执业医师指导下，在医疗、预防、保健机构中试用（或实习）期满一年。取得执业助理医师资格后，可以通过考试考取执业医师资格。4、考试难度不同执业助理医师的考试难度要比执业医师低，尤其是在医学综合笔试部分。在相同考试时间内，执业医师的笔试题题量是执业助理医师的两倍。执业助理医师考试会不采用或适当减少A3型题。由此可见，执业助理医师考试难度明显降低。
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