一、组织结构层次不同财政部是国务院的一个部门，国家税务总局是国务院直属机构，两者都归属于国务院管辖。二、职能有区别又有联系财政部主要制定并执行国家财政政策，财政政策包括政府支出和税收收入等多个方面。税务部门只管理税收方面的具体问题。三、税收管辖范围的区别财政部对税收问题的管辖是宏观上的管辖，主要：（1）从宏观上拟定和执行税收的发展战略、方针政策、中长期规划、改革方案及其他有关政策；（2）提出税收立法计划，与国家税务总局共同审议上报税法和税收条例草案；根据国家预算安排，确定财政税收收入计划；（3）提出税种增减、税目税率调整、减免税和对中央财政影响较大的临时特案减免税的建议；（4）参加涉外税收和国家关税谈判，签订涉外税收协议、协定草案；制定国际税收协议和协定范本；承办国务院关税税则委员会的日常工作。税务部门具体执行税务工作，具体包括： （1）拟定税收法律法规草案，制定实施细则；提出国家税收政策建议并与财政部共同审议上报、制定贯彻落实的措施。（2）组织实施税收征收管理体制改革；制定征收管理制度；监督检查税收法律法规、方针政策的贯彻执行。（3）组织实施中央税、共享税、农业税及国家指定的基金(费)的征收管理；编报税收长远规划和年度税收收入计划；对税收法律法规执行过程中的征管和一般性税政问题进行解释；组织办理工商税收减免及农业税特大灾歉减免等具体事项。（4）办理进出口商品的税收及出口退税业务。（5）组织税收宣传和理论研究；组织实施注册税务师的管理；规范税务代理行为。
秋秋花花
