一、组织性质不同：
会计师事务所是指依法设立并承办注册会计师业务的社会中介机构。
注册会计师协会是由注册会计师组成的职业团体。
二、组织形式不同：
会计师事务所的组织形式主要有两种：合伙事务所和由注册会计师或单位发起设立的有限责任事务所。
注册会计师协会的组织机构由会员代表大会、理事会与常务理事会和常设办事机构组成。
三、职责不同：
会计师事务所受当事人委托，为其承办有关审计、会计、咨询、税务等方面业务。
注册会计师协会是指导、监督和管理会计师事务所工作的。注册会计师协会的主要职责如下：
1、负责办理注册会计师注册、事务所设立有关事宜，监督、管理其执业情况。
2、审批和管理协会会员，拟定注册会计师执业准则、规则以及监督、检查实施情况，组织和推动注册会计师培训工作，组织实施注册会计师全国统一考试。
3、依法办理审批及监督、管理境外事务所和人员在境内开展业务的有关事项，组织业务交流，开展理论研究，协调行业内外部关系、维护会员合法权益，开展国际交流活动。
4、指导地方注册会计师协会工作，办理国家法律、行政法规和国家机关委托或授权的其他有关工作。
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