会计学院是嘉兴学院历史最为悠久的办学单位。其历史与90多年的校史同步，90年来为我国的经济建设事业培养了分布全国各地的大量的会计管理人才，可谓灿若星河，桃李满天下。1979年，浙江冶金工业学校升格为大专，更名为浙江冶金经济专科学校（简称为浙江冶专）。工业财务与会计专业在1978年试招大专生的基础上正式招收第一届大专生，是当时浙江冶专仅有的二个专业。到上世纪80年代末90年代初会计系成为浙江经专最大的系部，学生人数几乎占了全校的一半。嘉兴学院的历史发展来看，嘉兴学院强势专业可以说是浙江省会计学、统计学、经济学，国际贸易，因为这个学校的前身是1914年宁县甲等事业学校，实际上在80年代的时候这个学校的名字是浙江经济高等专业学科，所以从历史的角度来看这个学校的经济管理类专业是比较强势的。只不过从90年代后期之后，我们浙江财经学院由于地理位置在杭州的关系，所以报的学生比较多，相对应而言我们的经济管理类排列第二，应该说是排在经济管理类专业的前列的，这是从历史的角度来分析。从现实的角度来看，目前我们的应用数学专业、人力资源管理专业、机电、机械设计及自动化专业是属于比较强势的专业，考生报的比较多。所以嘉兴学院的优势就在于它属于原来的浙江经济高等专科学校和嘉兴高等专科学校，一个是以经管类为主，一个是工科为主的两个学校合并之后，组建了一个新的嘉兴学院，所以它的专业是以工科、经管类为主，所以身受广大考生的欢迎。2000年嘉兴学院首次招收本科生，会计系的财务管理专业是率先招生的七个本科专业之一。2001年会计学专业开始招收本科生，成为所有专业均招收本科生的二级院系。2003年7月，成立会计学院。现有会计学和财务管理两个专业，会计学专业下设注册会计师和国际会计两个方向。在校本专科学生近800名。
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