内部审计工作流程如下：
(1) 依据上级部署和本单位具体情况，拟订审计工作计划，报经本单位领导批准后，制订审计方案，进行审计工作。
(2) 对审计中发现的问题，可随时向有关单位和人员提出改进意见。审计终了，应提出审计报告，在征求被审计单位的意见后，报送本单位领导，重要的应同时报送同级国家审计机关。
(3) 对重大审计事项作出的处理决定，须报经本单位领导批准。经批准的处理决定，被审计单位必须执行。
(4) 被审计单位对处理决定如有异议，可在15日内向本单位负责人或上级内部审计机构提出申诉; 对部门内部审计机构的处理决定如有异议，可向部门负责人提出申诉。
单位负责人、上级内部审计机构和部门负责人，应在接到申诉30日内作出处理，对不适当的处理决定予以纠正。申诉期间，原审计处理决定应照常执行。
审计方法：
1、顺查法。按照经济活动发生的先后顺序和会计核算程序，依次审核和分析会计凭证、会计帐簿和会计报表。
2、逆查法。按照经济活动进行的相反顺序，先审查会计报表，从中发现错弊和问题，然后有针对性地依次审查和分析报表、帐簿和凭证。
3、抽查法。提供三种抽样方法，包括等距抽样、随机抽样、PPS抽样，从被审单位被审计对象中抽取其中一部分进行审查，根据审查结果，借以推断审计对象总体有无错误和弊端。
4、抽样审计与详细审计结合法。在审计实践中，审计人员确定审计样本是在内控制度与重要性水平评估的基础上进行的，当对某一样本产生怀疑时，审计人员可能会扩大样本的数量或对某一样本的业务流程进行详细审计。
参考资料来源：百度百科--内部审计程序
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