一、培养目标不同：
会计电算化的培养目标是：培养熟悉会计基本理论及相关经济管理知识，运用计算机进行会计操作的技能，能适应各类企事业单位要求，胜任出纳、审计、税务、材料物资核算、工资核算、成本核算、收入和利润核算、总账报表等会计岗位工作的高技能应用型人才。
会计专业的培养目标是：培养具有诚信、敬业的良好职业素质，熟悉国家经济法律法规，系统掌握会计理论与会计实务的高级技术应用性专门人才。
二、课程设置不同：
会计电算化专业的课程体系包括如下两个方面。
（一）实践教学课程体系
本专业的实践教学课程体系包括培养对应岗位（群）技能所需的会计学原理、财务会计、财务管理、审计等专业基础课的实验课，会计电算化、企业会计模拟实训、Excel在会计中的应用、纳税实务等专业课的实训课和校外顶岗实习。
（二）知识/理论课程体系
知识/理论课程体系包括包括思想道德、计算机、大学英语、财经应用文写作等通识教育的公共基础课，必要的管理学基础、财务会计等专业基础课和会计电算化、企业会计模拟实训、Excel在会计中的应用、纳税实务等专业技能课。
会计专业的课程设置如下：
编辑关系型数据库、基础会计、财政与金融基础知识、税收基础、统计基础知识、经济法律法规、会计基本技能、企业财务会计、财务管理、政府与非营利组织会计、会计电算化、审计基础知识、会计模拟实习、商品知识、商业会计模拟、金融业会计实务、商业银行业务、金融市场银行会计模拟等。
三、考取证书不同：
会计电算化专业可考证书：英语等级证书；计算机等级证书；会计电算化证；会计从业资格证书等。
会计专业可以考取证书：
会计从业资格考试、会计资格考试（初级、中级）、高级会计师考试、注册会计师考试CPA、注册资产评估师、注册国际注册内部审计师CIA、国际信息系统审计师CISA、加拿大注册会计师考试CGA、特许公认会计师考试（ACCA）、公认会计技师考试（CAT）。
参考资料：
百度百科-会计电算化专业
百度百科-会计专业
家装e站重庆站
