商标申请注册费用计入科目如下：1、如果是外购或接受出资人投入的商标，注册费要计入无形资产初始成本；2、对于本企业注册自创的商标，由于注册费本身花费不大，可以计入当期的管理费用。如果注册费用较大，由于根据会计准则中“内部开发的无形资产的计量”中的规定，无形资产成本由可直接归属于该资产的创造、生产并使该资产能够以管理层预定的方式运作的所有必要支出组成，因此注册费可以资本化。申请商标流程如下：1、申请商标注册；2、商标审查；3、初审公告，需要强调的是，经过商标局初审通过的商标，要在刊登公告三个月后无人提出异议才可以注册完成，该商标即受法律保护；4、注册公告； 5、领取商标注册证。《中华人民共和国商标法》第四条 自然人、法人或者其他组织在生产经营活动中，对其商品或者服务需要取得商标专用权的，应当向商标局申请。第三条 经商标局核准注册的商标为注册商标，包括商品商标、服务商标和集体商标、证明商标；商标注册人享有商标专用权，受法律保护。本法所称集体商标，是指以团体、协会或者其他组织名义注册，供该组织成员在商事活动中使用，以表明使用者在该组织中的成员资格的标志。本法所称证明商标，是指由对某种商品或者服务具有监督能力的组织所控制，而由该组织以外的单位或者个人使用于其商品或者服务，用以证明该商品或者服务的原产地、原料、制造方法、质量或者其他特定品质的标志。集体商标、证明商标注册和管理的特殊事项，由国务院工商行政管理部门规定。
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