建立了一种用PCR方法筛选富含高度重复序列的大麦BAC DNA 文库和直接对 BAC DNA进行末端测序的方法。用PCR技术进行大麦BAC DNA 文库（含816个平板，每个平板含384个克隆）的筛选分4步进行。在实验中，建立了两个水平的BAC DNA池（一级池和二级池）。一个二级池由一个平板（含有384个克隆）的DNA 组成，一个一级池由连续10个稀释100倍的二级池的DNA混合而成（如1～10，11～20等），共82个一级池。BAC DNA 文库筛选的第一步是对82个一级池的筛选。得到阳性一级池后（如2号一级池），对其所含的10个二级池（从11～20）进行第二步筛选。得到阳性二级池后，培养相应的阳性平板的所有克隆（384个），从头开始（左上侧），每相邻的4个克隆为一组，在96孔板上(4 X 96=384) 进行第三轮PCR反应；之后对筛选结果为阳性的4个克隆分别进行菌落 PCR（第四轮）得到单一阳性克隆。根据BAC DNA Hind III 酶切指纹图谱，对同一引物筛选的BACs进行重叠群作图（Contig）。对代表contig 的两端的BAC DNA直接进行末端测序并对测序结果Blast, 以检测其在大麦中是否属于单拷贝序列。根据测序和Blast结果设计引物，用中国春附加系（附加大麦染色体）对来自BAC克隆的引物进行染色体定位并用分离群体进行遗传学作图，以确定是否可以用作下一步的染色体步行。
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