皈依三宝：佛、法、僧，其中皈依佛，就是皈依包括药师佛在内的所有的佛。不需单独皈依药师佛。皈依三宝，一般寺院要举行皈依法会，在出家僧人的见证下，发愿皈依三宝。授居家二众三皈、五戒仪轨 合掌，向佛相三问讯 香赞： 三皈纳体，五戒培基，浣涤遮障法凭师，心净受堪宜，仗佛弘慈，信香拜祷祈，南无香云盖菩萨摩诃萨（三称） 南无本师释迦牟尼佛（三称） 请圣： 请佛宝 弟子（法名）一心奉请：娑婆教主本师释迦牟尼佛，西方接引阿弥陀佛，当来下生弥勒尊佛，尽虚空遍法界一切诸佛，惟愿不违本誓，慈光摄照，证明受皈、戒；（向佛相一问讯）(三遍） 请法宝： 弟子（）一心奉请：大小二乘毗尼律藏，五篇三聚，解脱木叉，十二分经，权实教典，离欲真净，甚深法宝，谨运一心，皈命顶礼；（向佛相一问讯） （三遍） 请僧宝： 弟子（）一心奉请：观音势至，文殊普贤，清净海众，诸大菩萨，律藏会上优波离尊者，西天东土历代祖师，传南山宗诸大律师，中兴律祖慧云磬公大和尚，中兴止作见月体公大和尚，惟愿不违本誓，慈光摄照，证明受皈、戒；（向佛相一问讯） （三遍） 请护法： 弟子（）一心奉请：光明会上，寄位诸天，梵释四王，天龙八部，伽蓝土地，护戒神王，金刚力士，幽显灵祗，惟愿不违本誓，监坛护戒。（向佛相一问讯）（三遍） 忏悔： 弟子（）从于无始以至今生毁破三宝作一阐提 谤大乘经断学般若弑害父母出佛身血 污僧伽蓝破他梵行焚毁塔寺盗用僧物 起诸邪见拨无因果狎近恶友违背良师 自作教他见闻随喜如是等罪无量无边 故从今日生大惭愧克诚披露求哀忏悔 惟愿三宝慈悲摄受放净光明照触我身 诸恶消灭三障蠲除复本心源究竟清净（三次） 受三皈： 弟子（）尽形寿皈依佛尽形寿皈依法尽形寿皈依僧（向佛相一问讯）（三次） 三结： 弟子（）皈依佛竟，宁舍身命，终不皈依自在天魔等，皈依如来至尊等正觉，是我所尊，慈愍故；（向佛相一问讯）（三次） 弟子（）皈依法竟，宁舍身命，终不皈依外道典籍，皈依如来所说三藏十二部一切经典，是我所尊，慈愍故；（向佛相一问讯）（三次） 弟子（）皈依僧竟，宁舍身命，终不皈依外道邪众，皈依清净福田僧，是我所尊，慈愍故；（向佛相一问讯）（三次）
食客小蒲
