二级建造师注册时管理行政机构是指：行政机构亦称政府机构，是行政管理活动的重要主体，是行政权力、政府职能的物质载体。广义上的政府机构，是泛指国家政权机构的总称。狭义上的政府机构，是指依法建立，享有行政权力，担负行政职能的那一部分国家机构。在我国，是指中央和地方各级人民政府及其所属工作部门。政府机构这一概念，包括下列四层涵义：（1）政府机构是国家机构的组成部分；（2）政府享有的行政权力是国家权力的组成部分；（3）各级政府机构都是整个国家行政机关系统的组成部分；（4）政府机构以担负国家公共行政事务为主要职能。
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